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賽默飛世爾科技 Applied Biosystems 7500 實(shí)時(shí)熒光定量PCR系統(tǒng)的標(biāo)準(zhǔn)、安全操作流程。賽默飛世爾科技 Applied Biosystems 7500 實(shí)時(shí)熒光定量PCR系統(tǒng)的標(biāo)準(zhǔn)、安全操作流程。操作必須由經(jīng)過(guò)培訓(xùn)的人員在符合生物安全規(guī)定的實(shí)驗(yàn)室中進(jìn)行。不同版本的軟件界面可能略有差異,但核心步驟一致。
賽默飛7500實(shí)時(shí)熒光定量PCR系統(tǒng)標(biāo)準(zhǔn)操作流程
一、開(kāi)始階段:實(shí)驗(yàn)前準(zhǔn)備
1、儀器準(zhǔn)備
(1)開(kāi)機(jī): 依次打開(kāi)電腦主機(jī)、顯示器,然后打開(kāi)7500儀器主機(jī)電源(通常在儀器背面)。
(2)啟動(dòng)軟件: 雙擊桌面上的 “7500 System Software" 圖標(biāo)啟動(dòng)軟件。軟件將自動(dòng)進(jìn)行自檢和初始化,此過(guò)程約需10-15分鐘。請(qǐng)等待初始化完成,直至主界面就緒。
(3)檢查耗材: 確認(rèn)有足夠的一次性 MicroAmp® Optical 96-Well或8-Strip Reaction Plates(反應(yīng)板)和 Optical Adhesive Covers(光學(xué)封膜)。
2、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
(1)創(chuàng)建實(shí)驗(yàn)文件: 在軟件主界面,選擇 “Create New Experiment" 或 “File -> New"。
(2)選擇實(shí)驗(yàn)類型: 在實(shí)驗(yàn)設(shè)置向?qū)е校x擇 “Quantitation (Standard Curve)"(標(biāo)準(zhǔn)曲線定量)、“Comparative Ct (ΔΔCt)"(相對(duì)定量)或其他適合您實(shí)驗(yàn)的類型。
(3)設(shè)置探針/染料: 在 “Detectors" 或 “Dye Manager" 中,添加您實(shí)驗(yàn)中使用的熒光染料(如 FAM, VIC)或探針。為每個(gè)檢測(cè)目標(biāo)指定名稱和報(bào)告基團(tuán)/淬滅基團(tuán)類型。
(4)設(shè)置反應(yīng)體系: 指定反應(yīng)體積(通常為20-50 μL)。
3、配制PCR反應(yīng)體系
(1)在冰上或超凈工作臺(tái)中操作: 確保所有試劑解凍并短暫離心。
(2)配制預(yù)混液: 根據(jù)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),按比例混合除模板DNA外的所有試劑(如Master Mix、引物、探針、水)。建議配制一定冗余(例如,多配10%的量)以補(bǔ)償加樣誤差。
(3)分裝: 將預(yù)混液分裝到PCR反應(yīng)板或八連管中。
(4)加入模板: 最后加入模板DNA,并輕輕混勻(避免產(chǎn)生氣泡)。強(qiáng)烈建議設(shè)置復(fù)孔(至少3個(gè)技術(shù)重復(fù))以及陰性對(duì)照(No Template Control, NTC)和陽(yáng)性對(duì)照。
(5)封膜: 使用光學(xué)封膜密封反應(yīng)板,確保封膜平整、無(wú)褶皺、無(wú)氣泡。然后用壓膜器或滾輪用力壓實(shí)邊緣。
4、上樣
(1)清潔樣品槽: 用無(wú)水乙醇和無(wú)塵紙輕輕擦拭7500儀器的樣品槽基座,去除任何灰塵或污染物。
(2)放置反應(yīng)板: 將封好膜的反應(yīng)板放入樣品槽中,確保反應(yīng)板的左上角(A1孔)對(duì)準(zhǔn)樣品槽的左上角標(biāo)記。輕輕向下按壓四角,確保板子放置平穩(wěn)。
二、第二階段:上機(jī)運(yùn)行
1、創(chuàng)建運(yùn)行方法
(1)設(shè)置反應(yīng)板布局: 在軟件界面,點(diǎn)擊 “Plate Setup" 選項(xiàng)卡。通過(guò)拖放或雙擊,為每個(gè)孔指定其樣品名稱、任務(wù)類型(未知樣品、標(biāo)準(zhǔn)品、陰性對(duì)照等)和對(duì)應(yīng)的檢測(cè)探針(Detector)。
(2)編輯運(yùn)行程序:
點(diǎn)擊 “Instrument" 選項(xiàng)卡。
Stage 1 (升溫階段): 通常為 50°C for 2 minutes(UDG酶防污染孵育,如果試劑包含此成分)。
Stage 2 (預(yù)變性): 通常為 95°C for 10-20 minutes(熱啟動(dòng)酶活化)。
Stage 3 (PCR循環(huán)): 設(shè)置40-50個(gè)循環(huán),包括:
(3)變性: 95°C for 15 seconds。
退火/延伸: 60°C for 1 minute。在此步驟采集熒光信號(hào)。軟件通常會(huì)自動(dòng)設(shè)置為在60°C階段采集信號(hào)。
(可選)溶解曲線階段: 如果使用SYBR Green染料,需添加溶解曲線步驟。
2、開(kāi)始運(yùn)行
(1)保存方法: 保存您的實(shí)驗(yàn)文件和運(yùn)行方法。
(2)啟動(dòng)運(yùn)行: 點(diǎn)擊工具欄上的 “Start Run" 按鈕。
(3)確認(rèn)運(yùn)行參數(shù): 在彈出的對(duì)話框中,再次確認(rèn)反應(yīng)板位置、運(yùn)行方法文件名和樣品文件名無(wú)誤。
(4)開(kāi)始運(yùn)行: 點(diǎn)擊 “OK",儀器將開(kāi)始運(yùn)行。運(yùn)行過(guò)程中,您可以實(shí)時(shí)查看擴(kuò)增曲線和熒光信號(hào)的變化。
三、第三階段:數(shù)據(jù)分析與關(guān)機(jī)
1、數(shù)據(jù)分析
(1)運(yùn)行結(jié)束后,軟件會(huì)自動(dòng)保存數(shù)據(jù)。
(2)設(shè)置基線閾值(Threshold)和基線(Baseline): 這是數(shù)據(jù)分析的關(guān)鍵步驟。
軟件通常會(huì)自動(dòng)設(shè)置,但手動(dòng)調(diào)整可能使結(jié)果更準(zhǔn)確。
閾值(Threshold): 設(shè)置在指數(shù)擴(kuò)增期的線性范圍內(nèi),通常為熒光信號(hào)剛進(jìn)入指數(shù)增長(zhǎng)階段的水平。所有樣本的閾值線應(yīng)保持一致。
基線(Baseline): 設(shè)置為背景熒光信號(hào)平穩(wěn)的循環(huán)數(shù)范圍(通常是前3-15個(gè)循環(huán))。
(3)查看結(jié)果: 軟件會(huì)自動(dòng)給出每個(gè)樣品的Ct值。您可以在 “Results" 頁(yè)面查看擴(kuò)增曲線、標(biāo)準(zhǔn)曲線(如果做了)、熔解曲線(如果做了)以及最終的定量結(jié)果。
2、關(guān)機(jī)
(1)取出反應(yīng)板: 運(yùn)行結(jié)束后,打開(kāi)儀器蓋子,小心取出反應(yīng)板。注意:反應(yīng)板可能很燙,請(qǐng)佩戴防燙手套。
(2)處理廢液: 根據(jù)您實(shí)驗(yàn)室的生物安全規(guī)定,將反應(yīng)板作為生物有害廢物妥善處理。
(3)清潔樣品槽: 再次用無(wú)水乙醇和無(wú)塵紙清潔樣品槽。
(4)關(guān)閉軟件: 在電腦上退出7500系統(tǒng)軟件。
(5)關(guān)閉儀器: 先關(guān)閉7500儀器主機(jī)電源,然后再關(guān)閉電腦。
遵循以上標(biāo)準(zhǔn)操作流程,并結(jié)合您具體的實(shí)驗(yàn)方案和試劑說(shuō)明書(shū)進(jìn)行優(yōu)化,將能確保您獲得可靠、準(zhǔn)確的實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果。如有任何不確定之處,請(qǐng)務(wù)必咨詢經(jīng)驗(yàn)豐富的同事或賽默飛的技術(shù)支持。