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QuantStudio 1是一個經典的入門級qPCR儀,使用96孔板進行實驗。其所需的耗材和試劑可以分為兩大類:儀器專用耗材和通用試劑。
一、賽默飛QuantStudio1實時熒光定量PCR核心耗材
1、反應板 / 板子
(1)微孔板: 常用的是標準96孔PCR板。重要的是,板子的材質必須是光學級的,以確保熒光信號能被儀器準確檢測。
(2)推薦品牌: 當然是賽默飛原廠的MicroAmp™ Fast 96孔反應板(貨號例如:4346906),因為它與儀器的兼容性和光學性能都經過優化。
(3)兼容品牌: 其他有名氣品牌(如 Axygen, Bio-Rad, Eppendorf 等)生產的標準96孔光學PCR板通常也可以使用,但建議進行驗證以確保實驗結果穩定。
2、光學蓋膜或蓋板
這是密封反應板、防止樣品蒸發和污染的關鍵部件。QuantStudio 1系統主要支持兩種方式:
(1)光學粘合膜: 這是一次性的透明粘性薄膜,直接貼在反應板上。
(2)推薦: 賽默飛MicroAmp™ 光學粘合膜(貨號:4311971)。這是常用、方便的選擇。
(3)光學蓋板: 這是一個可重復使用的硬質透明蓋板。使用時需要在蓋板和反應板之間加一層墊圈以確保密封。
(4)推薦: 賽默飛MicroAmp™ 光學8聯管蓋(適用于8聯管)或相應的96孔光學蓋板??芍貜褪褂?,長期成本可能更低,但需要清洗和小心維護。
總結: 最基本的耗材組合是 “96孔光學PCR板 + 光學粘合膜"。
二、賽默飛QuantStudo1實時熒光定量PCR核心試劑
1、熒光定量PCR預混液
這是核心試劑,包含了DNA聚合酶、dNTPs、緩沖液等。根據檢測方法不同,主要分為兩大類:
(1)染料法(SYBR Green):
原理: 使用SYBR Green染料,它能非特異性地嵌入所有雙鏈DNA中發出熒光。
優點: 便宜,使用靈活。
缺點: 特異性相對較低,會與非特異性產物結合,需要配合熔解曲線分析來驗證結果。
推薦試劑: 賽默飛 PowerUp™ SYBR™ Green預混液(貨號:A25742)或其經典的 SYBR™ Select Master Mix。其他品牌的SYBR Green預混液也廣泛適用。
(2)探針法(TaqMan):
原理: 使用序列特異性的寡核苷酸探針,探針上帶有熒光報告基團和淬滅基團,特異性高。
優點: 特異性高,適合多靶標檢測(多重PCR)。
缺點: 成本較高,探針需要單獨設計合成。
推薦試劑: 賽默飛 TaqMan™ Fast Advanced預混液(貨號4444557)或其他 TaqMan™ Universal Master Mix。
2、引物和探針
(1)引物: 無論是染料法還是探針法,都需要一對特異性引物來擴增目標基因。
(2)探針: 僅用于探針法,需要根據目標序列設計并標記好熒光基團(如FAM, VIC等)。
3、模板DNA/cDNA
您要檢測的樣品核酸。如果是檢測RNA,則需要先通過反轉錄反應將RNA逆轉錄成cDNA,然后再進行qPCR。
三、標準工作流程總結
1、實驗設計: 確定使用染料法還是探針法。
2、配制預混液: 在無菌環境下,將預混液、引物/探針、水混合。
3、分裝: 將預混液分裝到96孔光學板或8聯管中。
4、加入模板: 加入您的DNA/cDNA模板。
5、密封: 貼上光學粘合膜或蓋上光學蓋板。
6、離心: 短暫離心,去除氣泡。
7、上機運行: 將反應板放入QuantStudio 1儀器中,設置好反應程序(退火、延伸溫度和時間等)和熒光檢測通道,開始運行。
8、數據分析: 運行結束后,使用配套的QuantStudio Design & Analysis Software軟件進行數據分析(Ct值計算、標準曲線制作等)。